贝瑞课堂
单基因、染色体变异导致的遗传疾病，种类繁多、表型复杂又极为罕见，在诊断过程中，很容易与其他疾病混淆，难以做出正确的判断。为了帮助广大医务工作者顺利开展遗传病诊断工作，让更多遗传病患者早日查出病因，贝瑞基因特推出“贝瑞课堂”栏目，每周您只需花费约5分钟的时间，就可以对遗传疾病知识做一次高质量的积累。我们将按疾病类别对遗传疾病的临床指征、基因检测解决方案、典型临床案例等进行详细介绍，也欢迎大家在评论区展开讨论。
本期“贝瑞课堂”我们将对遗传性癫痫的检测策略进行介绍。
癫痫是除头痛外神经系统第二大常见慢性疾病，严重影响患者的认知及生活质量。我国癫痫患病率为千分之七，约有万癫痫患者，每年约有40万新发病的患者。导致癫痫的致病因素众多，包括结构性、遗传性、感染性、代谢性、免疫性等来源因素。
癫痫综合征类型繁多、表型复杂，尤其是遗传因素导致的癫痫综合征通过传统方法难以鉴别诊断。基因检测技术可辅助明确遗传性癫痫的致病机制，对其精准诊疗、判断预后及遗传咨询具有重要意义。
提示线索
除外结构性、免疫性、感染性、代谢病（血尿代谢筛查）等致病因素导致的癫痫发作；未找到其他明确病因的癫痫发作；有家族史、发作有热敏感性特点的患儿遗传因素致病可能性大；早发癫痫性脑病、发育落后患者遗传因素致病可能性大；通过MRI检测额颞区发育不良、脑白质发育落后、胼胝体发育不良时遗传因素致病可能性大。
相关基因
近年来与癫痫相关的基因被迅速发现，目前文献报道与癫痫相关的基因超过一千个，以儿童癫痫性脑病为例，其基因变异导致的致病机制涉及到DNA修复、转录调控、轴突髓鞘化、代谢物和离子转运、过氧化物酶体功能等多个生物学过程。
其遗传复杂性体现在：
一种癫痫综合征对应多个变异基因和多种变异形式；同一基因不同的变异位点、变异形式对应多种综合征。检测策略
全外显子组检测（WES）
技术特点：
涵盖20,个基因；检测范围包括SNV、50bp以内的Indel、单基因范围内及大片段缺失、重复。适用人群：
大多数无显著特异性临床表征的癫痫发作患者；通过系列检查无法明确病因的癫痫发作患者。检测策略
全基因组拷贝数变异检测
（CNV-seq）
技术特点：
全基因组均匀覆盖；
检测范围为大于kb的拷贝数变异；
可检测低至5%的非整倍体嵌合。
适用人群：
有癫痫发作且伴有智力障碍或发育落后的患者；
有癫痫发作且伴有多发畸形的患者。
检测策略
WES+CNV-seq近乎全基因组的检测方案
适合于除二代测序不能检测的特殊致病机制（如动态突变、基因印记等）以外近乎所有癫痫综合征的检测，一次性检出大、中、小型变异，更全面。
检测策略
其他检测技术
特征性很强的癫痫综合征，且单一基因突变可以解释绝大多数病人（70-80%），如Dravet综合征的SCN1A,Rett综合征的MECP2等，可进行单基因检测。多种遗传学致病机制或非孟德尔遗传，如点突变、CNV、UPD、甲基化突变、线粒体突变等，需综合使用多种检测技术。送样建议
先证者及父母或其他家系成员外周血各2ml（建议使用贝瑞基因标准采样包）;建议提供先证者尽可能详细的临床信息及既往检查结果，有利于提升检出率；建议提供先证者父母或三代以内的家系图及家属表型信息，有助于遗传模式、家系共分离、不完全外显等情况的分析与判断，提升检出率。为了帮助大家更好地理解本期内容，下一期“贝瑞课堂”，我们进行遗传性癫痫典型案例的讲解。内容精彩，敬请期待！
贝瑞优势
大数据分析，专业精准
作为平台型企业，贝瑞基因致力于构建大数据库与云计算平台，始终坚守着对数据分析能力的匠心追求，自主开发了数据分析整体解决方案，让大数据挖掘为遗传病诊疗赋能。
遗传咨询，国际水准
贝瑞基因借鉴国际遗传咨询的先进模式，组建了由国际遗传咨询专家和贝勒医学院生物信息专家带领的40余人的遗传咨询团队及报告解读团队，可辅助临床医生针对项目检测前、检测中、检测后提供专业的咨询服务。
检测前咨询-检测技术选择、知情内容解释等检测中咨询-临床信息标准语义转化、临床信息辅助收集等检测后咨询-检测报告解读、病例探讨、遗传咨询报告出具、临床干预方案提供等
